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O CAUNESP Centro de Aqüicultura da Unesp é uma unidade complementar da Universidade, criada em 1988 que integra docentes de 07 unidades da Unesp que atuam no sentido de gerar e difundir conhecimentos referentes à biologia, cultivo, economia e processamento de organismos aquáticos, bem como à estrutura e funcionamento dos ecossistemas hídricos.